La Biblioteca de la Universidad Nacional de Tres de Febrero, comienza a funcionar en la primera sede de la UNTREF, en la localidad de El Palomar en la Calle Los Aromos, el 7 de enero de 2002. La directora designada fue Marta Marilef. En la actualidad, la dirección está a cargo de Mariana Ambrosio, quien en el inicio de las actividades era una de las tres estudiantes de bibliotecología, junto a Marta Cardoni y Alicia Donato. Las tareas comenzaron siendo el sellado e inventariado de los primeros ejemplares de libros, para volcar los datos en una planilla de Excel. Luego se comenzaron a cargar registros en el software Winisis, junto a los demás procedimientos referidos a la gestión.
En el mes de marzo, la Biblioteca se trasladó a la nueva sede construida por la universidad en Caseros (actual Sede I). Se contaba con 1500 ejemplares y algunas publicaciones.
La Biblioteca de la institución, nace para apoyar y acompañarla en su tarea de enseñar, investigar y brindar servicios a la comunidad académica y a la sociedad optimizando el acceso a los recursos bibliográficos e informáticos mediante la implementación de herramientas técnicas actualizadas y asumir su rol central de difusor y gestor de la información y el conocimiento, en un espacio de libre acceso a las ideas y la creación.
En en el período comprendido entre los años 2014 y 2015, un equipo realiza 4 viajes a Maimará (Jujuy), para informatizar la Biblioteca personal de Rodolfo Kusch y realizar tareas de restauración de los ejemplares. También se comienza con el trabajo sobre el Fondo de archivo que lleva su nombre. Se creó el Cuadro de Clasificación y se digitalizaron las primeras 5 cajas de los originales producidos por el pensador argentino. Dicha sede quedó a cargo de Lina Mamani y actualmente está siendo gestionada por la familia, a través de Veronica Kusch (nieta de Rodolfo y Elizabeth Lanata de Kusch).
El 29 de noviembre de 2023 se realiza el primer traslado de ejemplares a la nueva sede construida en el Campus de Villa Lynch. En abril de 2025 comienza la atención al público para préstamo o devolución de ejemplares, y el martes 13 de mayo del mismo año, se habilita el ingreso a los primeros usuarios de la sala.
Actualmente se cuenta con cuatro sedes que trabajan de forma coordinada y cooperativa, conformando el sistema de Bibliotecas de la UNTREF.